Хорхе Лоренсо спечели трети пореден пол-позишън през сезона, след като се оказа най-бърз в оспорваната квалификация за Гран При на Малайзия.
В последните минути на сесията, водачът в класирането Лоренсо бе четвърти и имаше шанс да стартира след основния си противник за титлата Дани Педроса. Педроса бе най-бърз в по-голямата част от квалификацията, преди Андреа Довициозо Тек 3 Ямаха да вземе лидерството. Педроса скоро се върна начело, но само, за да предаде пак преднината на италианеца в последната му обиколка.
Все пак испанецът успя да изпревари със стотни Довициозо, записвайки време 2:00.528 срещу 2:00.567 на италианския си противник. Лоренсо пък мина и дваматаси противници с 2:00.434. Последва още по-убедителна обиколка на лидера в шампионата и време 2:00.334. Кейси Стоунър ще стартира четвърти, а пети е Кал Кръчлоу, следван от Бен Спийс. Хектор Барбера показа най-добрата си форма след отсъствието заради травма, вземайки седмата стартова позиция. Щефан Брадл остана осми.